Erpe-Mere ligt in het zuidoostelijke deel van de provincie Oost-Vlaanderen en behoort administratief tot het arrondissement Aalst.
Erpe-Mere is een buurgemeente van de stad Aalst en van de gemeenten Haaltert, Herzele, Sint-Lievens-Houtem en Lede.
Erpe-Mere is gelegen langs de E40, waarvan u een op- en afrittencomplex vindt op het grondgebied van de gemeente en wordt doorkruist door de gewestwegen N 9 (Gentsesteenweg) en N 442 (Leedsesteenweg) en de provinciale weg N 46 (Oudenaardsesteenweg).
Erpe-Mere wordt ook doorsneden door een drietal spoorlijnen. De spoorlijn 50a Brussel-Oostende heeft geen stations op het grondgebied van de gemeente. Op de lijn 89 Brussel-Kortrijk ligt het station van Burst en op de spoorlijn 82, Aalst-Burst, die van lokaal belang is en intensief gebruikt wordt door naar Aalst reizende leerlingen, vinden we het station van Burst en stopplaatsen te Bambrugge, Erpe-Mere (aan de Oudenaardsesteenweg tussen Erpe en Mere) en Vijfhuizen (Erpe).